A COESI é administrada por uma Diretoria responsável por executar e gerir as diretrizes da cooperativa. A escolha dos membros da Diretoria e do Conselho Fiscal acontece de maneira democrática durante as Assembleias Gerais, promovendo um processo aberto e participativo. Enquanto cooperativa do ramo CRÉDITO, sendo uma instituição financeira, a COESI está sujeita à supervisão rigorosa do Banco Central do Brasil e realiza auditorias interna e cooperativa anualmente, garantindo que todas as operações estejam em conformidade com as regulamentações vigentes.